A bandeira de Niue, que foi oficialmente adotada após a conquista da autonomia em 1975, é um tecido amarelo com uma Union Jack modificada colocada no cantão da bandeira, ou seja, com cinco estrelas douradas, sendo que uma estrela maior está no centro de um disco azul e outras quatro estrelas menores estão dispostas em forma de cruz.
Niue foi anexada pela Grã-Bretanha em 21 de abril de 1900. Isso aconteceu depois que o rei de Niue apelou à Grã-Bretanha pedindo proteção e anexação. A ilha tentou estabelecer relações diplomáticas externas, pois se sentia ameaçada por outras potências coloniais. Nessa época, a bandeira britânica foi usada, pois a ilha passou a fazer parte do Império Britânico.
Depois disso, em 11 de junho de 1901, a ilha passou a fazer parte da colônia da Nova Zelândia. A Grã-Bretanha entregou a custódia à Nova Zelândia, pois esta já tinha as Ilhas Cook sob seus cuidados, e Niue foi anexada como parte desses territórios. Algumas fontes indicam que esse estágio ocorreu em 1903, mas isso pode ser devido à conclusão oficial das formalidades e dos processos de transferência de Niue para a custódia da Nova Zelândia. Entretanto, a maioria das fontes indica que foi em junho de 1901 que Niue foi transferida da Grã-Bretanha para a Nova Zelândia. Desde então, a bandeira da Nova Zelândia tem sido usada em comemorações oficiais e em instituições administrativas.
Niue recebeu o status de governo autônomo em 19 de outubro de 1974, como resultado de um processo constitucional organizado com o apoio da Nova Zelândia. Foi realizado um referendo antes da concessão do governo autônomo, no qual a maioria da população de Niue apoiou essa medida, embora tivesse a opção de permanecer como parte da Nova Zelândia. De acordo com o acordo, Niue recebeu total autonomia em assuntos internos, o direito de ter sua própria constituição, governo e legislação, mas manteve um relacionamento especial com a Nova Zelândia. A ilha tornou-se um estado livremente associado à Nova Zelândia, que é responsável pela defesa e pelas relações internacionais de Niue, além de fornecer assistência econômica e técnica.
A bandeira atual de Niue foi adotada oficialmente em 15 de outubro de 1975, cerca de um ano depois que Niue ganhou o status de governo autônomo em associação livre com a Nova Zelândia. A bandeira foi desenhada por Patricia Rex, esposa do primeiro primeiro-ministro de Niue, Sir Robert Rex. O desenho da bandeira inclui a Union Jack, simbolizando os laços históricos de Niue com o Reino Unido. As quatro pequenas estrelas ao redor da Union Jack representam o relacionamento próximo de Niue com a Nova Zelândia, e a grande estrela no centro simboliza o status de autogoverno de Niue no Pacífico.
