A bandeira, que é usada oficialmente desde 1981, tem o brasão de Jersey coroado com a coroa Plantageneta. Antes disso, a bandeira era uma simples cruz diagonal vermelha de São Patrício em um fundo branco.

A pesquisa histórica não foi capaz de estabelecer a origem dessa bandeira. Entre as lendas está a história de que uma tradução errônea do holandês da palavra “Erse” (“Irlandês”) em um mapa holandês rotulou erroneamente “Ierse” (Jersey) com uma cruz vermelha de São Patrício. No entanto, os mapas do Almirantado francês mostram que Jersey usava uma cruz diagonal vermelha mesmo antes da adoção desse símbolo para a Ordem de São Patrício e sua inclusão na moderna bandeira da União.
Alguns argumentam que a cruz vermelha é de origem normanda. A cruz vermelha da Ordem de São Patrício foi emprestada no final do século XVIII da heráldica da família hiberno-normanda Fitzgerald. Se esse é um antigo símbolo normando, então a cruz vermelha de Jersey pode ter a mesma origem. Jersey, juntamente com as outras Ilhas do Canal, recebeu neutralidade do Papa durante a guerra entre a Inglaterra e a França. Como podiam negociar livremente com ambos os lados, os navios de Jersey precisavam de uma maneira de se distinguir dos navios ingleses. Assim, eles giraram a cruz de São Jorge.
Na segunda metade do século XX, quando Jersey ganhou mais peso no cenário internacional, muitos acharam que a bandeira não era suficientemente distinta para representar a ilha, que havia muita confusão com a Cruz de São Patrício como símbolo irlandês e que ela foi adotada como uma das bandeiras internacionais de sinalização marítima. No entanto, muitos queriam manter a cruz tradicional, que tem sido usada desde tempos imemoriais. Uma variante da bandeira com três leopardos, o símbolo heráldico da ilha, também foi proposta.
Assim, a bandeira atual pode ser vista como um compromisso entre diferentes tendências. Embora a bandeira seja hasteada em Jersey, os três leopardos são muito mais amplamente usados como símbolo nacional do governo e da população civil.