Criada em 1985, essa bandeira é relativamente nova. Antes disso, a bandeira de Guernsey consistia em uma simples cruz de São Jorge - vermelha em um fundo branco. Mas isso gerou alguma confusão, pois a mesma bandeira era usada pela Inglaterra. Assim, por exemplo, nos Jogos da Commonwealth, quando as equipes da Inglaterra e de Guernsey estavam competindo, outros competidores pensaram que a Inglaterra tinha duas equipes.
Assim, Guernsey decidiu que era necessário criar uma nova bandeira. Foi formado um comitê que, após muita reflexão e pesquisa, propôs continuar usando a Cruz de São Jorge, acrescentando a ela a cruz dourada de Guilherme, o Conquistador.

Sua Majestade, a Rainha, descreveu a bandeira da seguinte forma: uma cruz dourada sobreposta a uma cruz de São Jorge (que é a imagem da cruz no estandarte de Guilherme, o Conquistador). A nova bandeira foi hasteada pela primeira vez em 9 de maio de 1985, em homenagem ao 40º aniversário da libertação da ilha da ocupação durante a Segunda Guerra Mundial. A Cruz de São Jorge vermelha também é encontrada nas bandeiras de Alderney e Sark e, portanto, é um tema comum nas bandeiras usadas no Bailiado de Guernsey.