Antes da chegada dos europeus às ilhas de Samoa, as tribos locais não usavam bandeiras no sentido moderno do termo, e sua identidade era expressa por meio de símbolos culturais e espirituais, incluindo totens e rituais tribais. A primeira descoberta europeia das ilhas de Samoa ocorreu em 1722, quando o explorador holandês Jacob Roggeveen explorou a região pela primeira vez. Desde então, a região tem sido gradualmente atraída para a esfera de influência europeia. Durante o século XIX, as bandeiras das potências coloniais europeias podiam ser hasteadas em diferentes partes do arquipélago. A Samoa Americana, como um território, ficou oficialmente sob o controle dos EUA em 17 de abril de 1900. Desde sua adesão aos Estados Unidos, a Samoa Americana se integrou mais estreitamente ao sistema político e econômico desse país, mantendo grande parte de sua identidade cultural. Durante sessenta anos, somente a bandeira americana foi usada no território, até que foi tomada a decisão de criar sua própria bandeira para a identidade local.

A bandeira atual da Samoa Americana foi adotada oficialmente em 27 de abril de 1960. Ela foi desenhada com a cooperação de líderes locais e do Instituto de Heráldica do Exército dos EUA. Isso garantiu um equilíbrio entre as tradições locais e os símbolos dos EUA. A bandeira da Samoa Americana ficou em 17º lugar no ranking das melhores bandeiras da Associação Vexilológica da América do Norte, entre 51 bandeiras. Isso indica sua singularidade e alta apreciação do ponto de vista estético. A águia na bandeira simboliza a proteção dos Estados Unidos, enquanto os objetos tradicionais de Samoa simbolizam o poder e a sabedoria dos líderes locais. No entanto, oficialmente, o Dia da Bandeira é comemorado todos os anos em 17 de abril, em homenagem ao primeiro hasteamento da bandeira dos EUA na ilha. Assim, em 2024, a Samoa Americana comemorou o 124º aniversário da bandeira.